Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Traf1P39428 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Traf1P39428 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Traf1P39428 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Traf1P39428 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Traf1P39428 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Traf1P39428 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Traf1P39428 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Traf1P39428 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Traf1P39428 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Traf1P39428 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Traf1P39428 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Traf1P39428 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Traf1P39428 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Traf1P39428 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Traf1P39428 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Traf1P39428 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Traf1P39428 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Traf1P39428 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Traf1P39428 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Traf1P39428 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Traf1P39428 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Traf1P39428 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Traf1P39428 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Traf1P39428 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Traf1P39428 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Traf1P39428 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Traf1P39428 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Traf1P39428 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Traf1P39428 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Traf1P39428 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Traf1P39428 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Traf1P39428 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Traf1P39428 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Traf1P39428 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Traf1P39428 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Traf1P39428 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Traf1P39428 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Traf1P39428 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Traf1P39428 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Traf1P39428 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Traf1P39428 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Traf1P39428 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Traf1P39428 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Traf1P39428 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Traf1P39428 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Traf1P39428 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Traf1P39428 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Traf1P39428 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Traf1P39428 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Traf1P39428 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Traf1P39428 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Traf1P39428 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Traf1P39428 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Traf1P39428 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Traf1P39428 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Traf1P39428 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Traf1P39428 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Traf1P39428 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Traf1P39428 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Traf1P39428 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Traf1P39428 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Traf1P39428 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Traf1P39428 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Traf1P39428 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Traf1P39428 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Traf1P39428 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Traf1P39428 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Traf1P39428 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Traf1P39428 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Traf1P39428 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Traf1P39428 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Traf1P39428 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Traf1P39428 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Traf1P39428 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Traf1P39428 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Traf1P39428 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Traf1P39428 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Traf1P39428 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Traf1P39428 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Traf1P39428 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Traf1P39428 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Traf1P39428 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Traf1P39428 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Traf1P39428 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Traf1P39428 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Traf1P39428 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Traf1P39428 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Traf1P39428 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Traf1P39428 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Traf1P39428 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Traf1P39428 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Traf1P39428 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms