Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GTF3C6Q969F1 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GTF3C6Q969F1 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GTF3C6Q969F1 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GTF3C6Q969F1 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GTF3C6Q969F1 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
GTF3C6Q969F1 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GTF3C6Q969F1 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GTF3C6Q969F1 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
GTF3C6Q969F1 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
GTF3C6Q969F1 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
GTF3C6Q969F1 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GTF3C6Q969F1 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
GTF3C6Q969F1 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GTF3C6Q969F1 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GTF3C6Q969F1 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GTF3C6Q969F1 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
GTF3C6Q969F1 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
GTF3C6Q969F1 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GTF3C6Q969F1 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GTF3C6Q969F1 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GTF3C6Q969F1 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GTF3C6Q969F1 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GTF3C6Q969F1 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GTF3C6Q969F1 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GTF3C6Q969F1 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GTF3C6Q969F1 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GTF3C6Q969F1 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
GTF3C6Q969F1 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GTF3C6Q969F1 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GTF3C6Q969F1 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
GTF3C6Q969F1 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GTF3C6Q969F1 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GTF3C6Q969F1 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
GTF3C6Q969F1 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GTF3C6Q969F1 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GTF3C6Q969F1 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GTF3C6Q969F1 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GTF3C6Q969F1 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GTF3C6Q969F1 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GTF3C6Q969F1 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GTF3C6Q969F1 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GTF3C6Q969F1 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GTF3C6Q969F1 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GTF3C6Q969F1 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GTF3C6Q969F1 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GTF3C6Q969F1 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GTF3C6Q969F1 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
GTF3C6Q969F1 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GTF3C6Q969F1 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GTF3C6Q969F1 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GTF3C6Q969F1 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GTF3C6Q969F1 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
GTF3C6Q969F1 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GTF3C6Q969F1 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
GTF3C6Q969F1 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
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GTF3C6Q969F1 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
GTF3C6Q969F1 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
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GTF3C6Q969F1 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
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GTF3C6Q969F1 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
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GTF3C6Q969F1 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
GTF3C6Q969F1 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
GTF3C6Q969F1 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GTF3C6Q969F1 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GTF3C6Q969F1 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
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GTF3C6Q969F1 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GTF3C6Q969F1 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GTF3C6Q969F1 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GTF3C6Q969F1 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GTF3C6Q969F1 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GTF3C6Q969F1 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GTF3C6Q969F1 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GTF3C6Q969F1 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
GTF3C6Q969F1 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GTF3C6Q969F1 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GTF3C6Q969F1 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
GTF3C6Q969F1 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
GTF3C6Q969F1 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GTF3C6Q969F1 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GTF3C6Q969F1 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GTF3C6Q969F1 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GTF3C6Q969F1 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GTF3C6Q969F1 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
GTF3C6Q969F1 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GTF3C6Q969F1 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GTF3C6Q969F1 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GTF3C6Q969F1 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GTF3C6Q969F1 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GTF3C6Q969F1 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GTF3C6Q969F1 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
GTF3C6Q969F1 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GTF3C6Q969F1 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
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