Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TTLL9Q3SXZ7 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
TTLL9Q3SXZ7 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
TTLL9Q3SXZ7 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TTLL9Q3SXZ7 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TTLL9Q3SXZ7 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TTLL9Q3SXZ7 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TTLL9Q3SXZ7 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TTLL9Q3SXZ7 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TTLL9Q3SXZ7 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TTLL9Q3SXZ7 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TTLL9Q3SXZ7 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TTLL9Q3SXZ7 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TTLL9Q3SXZ7 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TTLL9Q3SXZ7 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
TTLL9Q3SXZ7 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TTLL9Q3SXZ7 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TTLL9Q3SXZ7 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TTLL9Q3SXZ7 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TTLL9Q3SXZ7 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TTLL9Q3SXZ7 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC1.19□□□□□ -2.22
TTLL9Q3SXZ7 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TTLL9Q3SXZ7 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TTLL9Q3SXZ7 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TTLL9Q3SXZ7 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TTLL9Q3SXZ7 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TTLL9Q3SXZ7 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TTLL9Q3SXZ7 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TTLL9Q3SXZ7 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
TTLL9Q3SXZ7 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
TTLL9Q3SXZ7 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
TTLL9Q3SXZ7 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
TTLL9Q3SXZ7 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
TTLL9Q3SXZ7 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TTLL9Q3SXZ7 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TTLL9Q3SXZ7 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TTLL9Q3SXZ7 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TTLL9Q3SXZ7 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TTLL9Q3SXZ7 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TTLL9Q3SXZ7 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TTLL9Q3SXZ7 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
TTLL9Q3SXZ7 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
TTLL9Q3SXZ7 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TTLL9Q3SXZ7 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TTLL9Q3SXZ7 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
TTLL9Q3SXZ7 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TTLL9Q3SXZ7 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TTLL9Q3SXZ7 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TTLL9Q3SXZ7 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TTLL9Q3SXZ7 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TTLL9Q3SXZ7 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
TTLL9Q3SXZ7 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TTLL9Q3SXZ7 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TTLL9Q3SXZ7 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TTLL9Q3SXZ7 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TTLL9Q3SXZ7 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TTLL9Q3SXZ7 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TTLL9Q3SXZ7 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TTLL9Q3SXZ7 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TTLL9Q3SXZ7 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TTLL9Q3SXZ7 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TTLL9Q3SXZ7 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TTLL9Q3SXZ7 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TTLL9Q3SXZ7 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TTLL9Q3SXZ7 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TTLL9Q3SXZ7 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TTLL9Q3SXZ7 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TTLL9Q3SXZ7 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TTLL9Q3SXZ7 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
TTLL9Q3SXZ7 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TTLL9Q3SXZ7 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TTLL9Q3SXZ7 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TTLL9Q3SXZ7 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TTLL9Q3SXZ7 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
TTLL9Q3SXZ7 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TTLL9Q3SXZ7 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TTLL9Q3SXZ7 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
TTLL9Q3SXZ7 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.17□□□□□ -2.22
TTLL9Q3SXZ7 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TTLL9Q3SXZ7 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TTLL9Q3SXZ7 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TTLL9Q3SXZ7 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TTLL9Q3SXZ7 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TTLL9Q3SXZ7 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TTLL9Q3SXZ7 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TTLL9Q3SXZ7 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
TTLL9Q3SXZ7 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TTLL9Q3SXZ7 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TTLL9Q3SXZ7 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TTLL9Q3SXZ7 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TTLL9Q3SXZ7 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TTLL9Q3SXZ7 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
TTLL9Q3SXZ7 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
TTLL9Q3SXZ7 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
TTLL9Q3SXZ7 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TTLL9Q3SXZ7 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.16□□□□□ -2.22
TTLL9Q3SXZ7 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
TTLL9Q3SXZ7 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TTLL9Q3SXZ7 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TTLL9Q3SXZ7 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.8 ms