Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Q1T7F1 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Q1T7F1 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Q1T7F1 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
Q1T7F1 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Q1T7F1 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC0.29□□□□□ -2.36
Q1T7F1 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Q1T7F1 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Q1T7F1 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Q1T7F1 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC0.29□□□□□ -2.36
Q1T7F1 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Q1T7F1 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Q1T7F1 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Q1T7F1 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Q1T7F1 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Q1T7F1 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Q1T7F1 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Q1T7F1 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Q1T7F1 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Q1T7F1 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Q1T7F1 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Q1T7F1 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Q1T7F1 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Q1T7F1 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Q1T7F1 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Q1T7F1 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Q1T7F1 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC0.28□□□□□ -2.36
Q1T7F1 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC0.28□□□□□ -2.36
Q1T7F1 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC0.28□□□□□ -2.36
Q1T7F1 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Q1T7F1 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Q1T7F1 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Q1T7F1 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC0.28□□□□□ -2.36
Q1T7F1 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Q1T7F1 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Q1T7F1 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Q1T7F1 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Q1T7F1 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Q1T7F1 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Q1T7F1 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC0.28□□□□□ -2.36
Q1T7F1 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Q1T7F1 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.27□□□□□ -2.37
Q1T7F1 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Q1T7F1 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Q1T7F1 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Q1T7F1 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Q1T7F1 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Q1T7F1 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Q1T7F1 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Q1T7F1 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Q1T7F1 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC0.27□□□□□ -2.37
Q1T7F1 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Q1T7F1 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Q1T7F1 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Q1T7F1 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Q1T7F1 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC0.27□□□□□ -2.37
Q1T7F1 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Q1T7F1 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Q1T7F1 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC0.27□□□□□ -2.37
Q1T7F1 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Q1T7F1 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Q1T7F1 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Q1T7F1 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Q1T7F1 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Q1T7F1 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Q1T7F1 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Q1T7F1 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Q1T7F1 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Q1T7F1 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Q1T7F1 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Q1T7F1 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Q1T7F1 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Q1T7F1 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Q1T7F1 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
Q1T7F1 CDKN3-205ENST00000458126 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.26□□□□□ -2.37
Q1T7F1 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Q1T7F1 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Q1T7F1 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Q1T7F1 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Q1T7F1 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Q1T7F1 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Q1T7F1 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Q1T7F1 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
Q1T7F1 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Q1T7F1 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Q1T7F1 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Q1T7F1 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Q1T7F1 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Q1T7F1 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Q1T7F1 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Q1T7F1 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Q1T7F1 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Q1T7F1 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Q1T7F1 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Q1T7F1 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Q1T7F1 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Q1T7F1 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Q1T7F1 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Q1T7F1 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Q1T7F1 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.5 ms