Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC1.74□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
KNOP1Q1ED39 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
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