Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CNGA3Q16281 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CNGA3Q16281 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CNGA3Q16281 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CNGA3Q16281 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CNGA3Q16281 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CNGA3Q16281 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
CNGA3Q16281 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
CNGA3Q16281 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CNGA3Q16281 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CNGA3Q16281 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CNGA3Q16281 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CNGA3Q16281 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CNGA3Q16281 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CNGA3Q16281 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CNGA3Q16281 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CNGA3Q16281 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
CNGA3Q16281 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CNGA3Q16281 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CNGA3Q16281 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
CNGA3Q16281 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CNGA3Q16281 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CNGA3Q16281 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
CNGA3Q16281 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CNGA3Q16281 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CNGA3Q16281 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CNGA3Q16281 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CNGA3Q16281 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CNGA3Q16281 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CNGA3Q16281 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CNGA3Q16281 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
CNGA3Q16281 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
CNGA3Q16281 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CNGA3Q16281 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CNGA3Q16281 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
CNGA3Q16281 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
CNGA3Q16281 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CNGA3Q16281 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CNGA3Q16281 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CNGA3Q16281 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CNGA3Q16281 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CNGA3Q16281 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CNGA3Q16281 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CNGA3Q16281 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CNGA3Q16281 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CNGA3Q16281 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CNGA3Q16281 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CNGA3Q16281 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CNGA3Q16281 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CNGA3Q16281 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CNGA3Q16281 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CNGA3Q16281 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CNGA3Q16281 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CNGA3Q16281 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CNGA3Q16281 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CNGA3Q16281 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CNGA3Q16281 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CNGA3Q16281 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CNGA3Q16281 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
CNGA3Q16281 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CNGA3Q16281 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CNGA3Q16281 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CNGA3Q16281 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CNGA3Q16281 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CNGA3Q16281 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CNGA3Q16281 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CNGA3Q16281 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CNGA3Q16281 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CNGA3Q16281 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CNGA3Q16281 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CNGA3Q16281 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CNGA3Q16281 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CNGA3Q16281 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CNGA3Q16281 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CNGA3Q16281 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CNGA3Q16281 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CNGA3Q16281 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CNGA3Q16281 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CNGA3Q16281 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CNGA3Q16281 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
CNGA3Q16281 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CNGA3Q16281 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CNGA3Q16281 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CNGA3Q16281 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CNGA3Q16281 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CNGA3Q16281 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CNGA3Q16281 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CNGA3Q16281 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CNGA3Q16281 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CNGA3Q16281 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CNGA3Q16281 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CNGA3Q16281 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CNGA3Q16281 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CNGA3Q16281 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CNGA3Q16281 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CNGA3Q16281 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CNGA3Q16281 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CNGA3Q16281 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CNGA3Q16281 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CNGA3Q16281 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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