Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
E2F4Q16254 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
E2F4Q16254 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
E2F4Q16254 AP003730.1-201ENST00000524605 285 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
E2F4Q16254 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
E2F4Q16254 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
E2F4Q16254 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
E2F4Q16254 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
E2F4Q16254 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
E2F4Q16254 PLCL1-203ENST00000437704 5979 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
E2F4Q16254 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
E2F4Q16254 PCDH11X-206ENST00000373097 9146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
E2F4Q16254 PRLR-217ENST00000618457 11688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
E2F4Q16254 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
E2F4Q16254 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
E2F4Q16254 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
E2F4Q16254 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
E2F4Q16254 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
E2F4Q16254 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
E2F4Q16254 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
E2F4Q16254 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
E2F4Q16254 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
E2F4Q16254 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
E2F4Q16254 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
E2F4Q16254 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
E2F4Q16254 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
E2F4Q16254 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
E2F4Q16254 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
E2F4Q16254 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
E2F4Q16254 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
E2F4Q16254 ABCA12-202ENST00000389661 7005 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
E2F4Q16254 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
E2F4Q16254 BCLAF1-214ENST00000531224 7263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
E2F4Q16254 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
E2F4Q16254 DOCK7-219ENST00000635253 6423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
E2F4Q16254 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
E2F4Q16254 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
E2F4Q16254 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
E2F4Q16254 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
E2F4Q16254 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
E2F4Q16254 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
E2F4Q16254 GALP-203ENST00000590002 150 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
E2F4Q16254 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
E2F4Q16254 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
E2F4Q16254 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
E2F4Q16254 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
E2F4Q16254 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
E2F4Q16254 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
E2F4Q16254 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
E2F4Q16254 PHF20L1-210ENST00000395390 5900 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
E2F4Q16254 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
E2F4Q16254 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
E2F4Q16254 MPDZ-215ENST00000541718 7603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
E2F4Q16254 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
E2F4Q16254 DTWD1-201ENST00000251250 13776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
E2F4Q16254 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
E2F4Q16254 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
E2F4Q16254 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
E2F4Q16254 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
E2F4Q16254 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
E2F4Q16254 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
E2F4Q16254 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
E2F4Q16254 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
E2F4Q16254 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
E2F4Q16254 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
E2F4Q16254 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
E2F4Q16254 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
E2F4Q16254 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
E2F4Q16254 ADGRL2-208ENST00000370725 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
E2F4Q16254 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
E2F4Q16254 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
E2F4Q16254 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
E2F4Q16254 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
E2F4Q16254 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
E2F4Q16254 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
E2F4Q16254 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
E2F4Q16254 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
E2F4Q16254 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
E2F4Q16254 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
E2F4Q16254 RPL29P14-201ENST00000495837 428 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
E2F4Q16254 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
E2F4Q16254 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
E2F4Q16254 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
E2F4Q16254 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
E2F4Q16254 uc_338.32-201ENST00000615087 172 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
E2F4Q16254 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
E2F4Q16254 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
E2F4Q16254 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
E2F4Q16254 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
E2F4Q16254 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
E2F4Q16254 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
E2F4Q16254 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
E2F4Q16254 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
E2F4Q16254 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
E2F4Q16254 RN7SL271P-201ENST00000487601 295 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
E2F4Q16254 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
E2F4Q16254 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
E2F4Q16254 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
E2F4Q16254 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
E2F4Q16254 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.4 ms