Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
SCN9AQ15858 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SCN9AQ15858 AC245884.10-201ENST00000597355 337 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SCN9AQ15858 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SCN9AQ15858 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SCN9AQ15858 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SCN9AQ15858 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SCN9AQ15858 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SCN9AQ15858 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SCN9AQ15858 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.56□□□□□ -2.32
SCN9AQ15858 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SCN9AQ15858 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SCN9AQ15858 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SCN9AQ15858 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SCN9AQ15858 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.56□□□□□ -2.32
SCN9AQ15858 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SCN9AQ15858 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SCN9AQ15858 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SCN9AQ15858 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC0.56□□□□□ -2.32
SCN9AQ15858 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SCN9AQ15858 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
SCN9AQ15858 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
SCN9AQ15858 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SCN9AQ15858 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SCN9AQ15858 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC0.56□□□□□ -2.32
SCN9AQ15858 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SCN9AQ15858 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SCN9AQ15858 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SCN9AQ15858 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
SCN9AQ15858 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SCN9AQ15858 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SCN9AQ15858 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SCN9AQ15858 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SCN9AQ15858 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SCN9AQ15858 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SCN9AQ15858 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SCN9AQ15858 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SCN9AQ15858 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SCN9AQ15858 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SCN9AQ15858 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SCN9AQ15858 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SCN9AQ15858 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SCN9AQ15858 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SCN9AQ15858 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SCN9AQ15858 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SCN9AQ15858 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.55□□□□□ -2.32
SCN9AQ15858 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC0.55□□□□□ -2.32
SCN9AQ15858 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SCN9AQ15858 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SCN9AQ15858 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC0.55□□□□□ -2.32
SCN9AQ15858 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SCN9AQ15858 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC0.55□□□□□ -2.32
SCN9AQ15858 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC0.55□□□□□ -2.32
SCN9AQ15858 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SCN9AQ15858 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SCN9AQ15858 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SCN9AQ15858 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SCN9AQ15858 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SCN9AQ15858 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SCN9AQ15858 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC0.55□□□□□ -2.32
SCN9AQ15858 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SCN9AQ15858 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SCN9AQ15858 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SCN9AQ15858 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SCN9AQ15858 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SCN9AQ15858 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC0.54□□□□□ -2.32
SCN9AQ15858 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SCN9AQ15858 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SCN9AQ15858 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SCN9AQ15858 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC0.54□□□□□ -2.32
SCN9AQ15858 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
SCN9AQ15858 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SCN9AQ15858 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
SCN9AQ15858 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SCN9AQ15858 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
SCN9AQ15858 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC0.54□□□□□ -2.32
SCN9AQ15858 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC0.54□□□□□ -2.32
SCN9AQ15858 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SCN9AQ15858 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SCN9AQ15858 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC0.54□□□□□ -2.32
SCN9AQ15858 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC0.54□□□□□ -2.32
SCN9AQ15858 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SCN9AQ15858 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SCN9AQ15858 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SCN9AQ15858 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SCN9AQ15858 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC0.54□□□□□ -2.32
SCN9AQ15858 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SCN9AQ15858 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SCN9AQ15858 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SCN9AQ15858 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SCN9AQ15858 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SCN9AQ15858 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SCN9AQ15858 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SCN9AQ15858 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC0.54□□□□□ -2.32
SCN9AQ15858 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SCN9AQ15858 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC0.54□□□□□ -2.32
SCN9AQ15858 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SCN9AQ15858 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SCN9AQ15858 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SCN9AQ15858 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
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