Protein–RNA interactions for Protein: Q15036

SNX17, Sorting nexin-17, humanhuman

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX17Q15036 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
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SNX17Q15036 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
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SNX17Q15036 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
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SNX17Q15036 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SNX17Q15036 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
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SNX17Q15036 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
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SNX17Q15036 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
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SNX17Q15036 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
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SNX17Q15036 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
SNX17Q15036 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
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SNX17Q15036 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
SNX17Q15036 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
SNX17Q15036 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
SNX17Q15036 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SNX17Q15036 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SNX17Q15036 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SNX17Q15036 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
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SNX17Q15036 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SNX17Q15036 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
SNX17Q15036 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SNX17Q15036 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SNX17Q15036 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SNX17Q15036 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SNX17Q15036 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
SNX17Q15036 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
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