Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.91□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HERC3Q15034 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
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