Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC-0.72□□□□□ -2.52
SHPRHQ149N8 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SHPRHQ149N8 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SHPRHQ149N8 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SHPRHQ149N8 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SHPRHQ149N8 DEFB131D-201ENST00000526803 184 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SHPRHQ149N8 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SHPRHQ149N8 VN1R87P-201ENST00000596706 487 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SHPRHQ149N8 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SHPRHQ149N8 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC-0.72□□□□□ -2.53
SHPRHQ149N8 RPL17P35-201ENST00000432217 549 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
SHPRHQ149N8 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
SHPRHQ149N8 MTND4P15-201ENST00000437913 1033 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
SHPRHQ149N8 LINC00446-202ENST00000438327 357 ntTSL 3 BASIC-0.72□□□□□ -2.53
SHPRHQ149N8 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC-0.72□□□□□ -2.53
SHPRHQ149N8 SNORD126-201ENST00000459475 77 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
SHPRHQ149N8 AC091212.1-201ENST00000474798 395 ntTSL 5 BASIC-0.72□□□□□ -2.53
SHPRHQ149N8 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC-0.72□□□□□ -2.53
SHPRHQ149N8 FAM96A-206ENST00000559950 561 ntTSL 2 BASIC-0.72□□□□□ -2.53
SHPRHQ149N8 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.53
SHPRHQ149N8 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SHPRHQ149N8 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC-0.73□□□□□ -2.53
SHPRHQ149N8 GYG2-AS1-201ENST00000445107 515 ntTSL 5 BASIC-0.73□□□□□ -2.53
SHPRHQ149N8 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SHPRHQ149N8 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SHPRHQ149N8 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SHPRHQ149N8 LINC02267-202ENST00000522173 799 ntTSL 3 BASIC-0.73□□□□□ -2.53
SHPRHQ149N8 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SHPRHQ149N8 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SHPRHQ149N8 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SHPRHQ149N8 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SHPRHQ149N8 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SHPRHQ149N8 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SHPRHQ149N8 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SHPRHQ149N8 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SHPRHQ149N8 RNA5SP300-201ENST00000391197 107 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SHPRHQ149N8 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC-0.74□□□□□ -2.53
SHPRHQ149N8 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SHPRHQ149N8 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC-0.74□□□□□ -2.53
SHPRHQ149N8 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC-0.74□□□□□ -2.53
SHPRHQ149N8 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SHPRHQ149N8 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC-0.74□□□□□ -2.53
SHPRHQ149N8 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SHPRHQ149N8 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC-0.74□□□□□ -2.53
SHPRHQ149N8 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SHPRHQ149N8 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SHPRHQ149N8 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC-0.74□□□□□ -2.53
SHPRHQ149N8 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.74□□□□□ -2.53
SHPRHQ149N8 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SHPRHQ149N8 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SHPRHQ149N8 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SHPRHQ149N8 Y_RNA.514-201ENST00000384528 112 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SHPRHQ149N8 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SHPRHQ149N8 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SHPRHQ149N8 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC-0.75□□□□□ -2.53
SHPRHQ149N8 MTCO3P15-201ENST00000526563 574 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SHPRHQ149N8 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC-0.75□□□□□ -2.53
SHPRHQ149N8 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SHPRHQ149N8 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.75□□□□□ -2.53
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SHPRHQ149N8 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SHPRHQ149N8 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SHPRHQ149N8 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SHPRHQ149N8 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC-0.75□□□□□ -2.53
SHPRHQ149N8 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
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SHPRHQ149N8 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SHPRHQ149N8 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SHPRHQ149N8 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SHPRHQ149N8 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SHPRHQ149N8 MIR3666-201ENST00000607845 111 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
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SHPRHQ149N8 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SHPRHQ149N8 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SHPRHQ149N8 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
SHPRHQ149N8 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
SHPRHQ149N8 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
SHPRHQ149N8 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC-0.76□□□□□ -2.53
SHPRHQ149N8 GXYLT1P1-201ENST00000446657 490 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
SHPRHQ149N8 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC-0.76□□□□□ -2.53
SHPRHQ149N8 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SHPRHQ149N8 Y_RNA.391-201ENST00000383933 94 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SHPRHQ149N8 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SHPRHQ149N8 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SHPRHQ149N8 HGF-207ENST00000453018 721 ntTSL 3 BASIC-0.77□□□□□ -2.53
SHPRHQ149N8 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SHPRHQ149N8 AC010376.1-201ENST00000522101 334 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SHPRHQ149N8 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SHPRHQ149N8 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SHPRHQ149N8 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SHPRHQ149N8 AC103706.2-201ENST00000638080 240 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SHPRHQ149N8 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SHPRHQ149N8 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SHPRHQ149N8 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SHPRHQ149N8 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SHPRHQ149N8 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SHPRHQ149N8 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SHPRHQ149N8 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SHPRHQ149N8 AC091917.1-201ENST00000506330 566 ntTSL 4 BASIC-0.78□□□□□ -2.53
SHPRHQ149N8 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
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