Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.48□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.47□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC1.47□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GPNMBQ14956 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
GPNMBQ14956 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GPNMBQ14956 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GPNMBQ14956 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.46□□□□□ -2.18
GPNMBQ14956 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GPNMBQ14956 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.9 ms