Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC2.54□□□□□ -2
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GBX1Q14549 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GBX1Q14549 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
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GBX1Q14549 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC2.53□□□□□ -2
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GBX1Q14549 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GBX1Q14549 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.53□□□□□ -2
GBX1Q14549 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
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GBX1Q14549 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GBX1Q14549 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
GBX1Q14549 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
GBX1Q14549 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
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GBX1Q14549 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
GBX1Q14549 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GBX1Q14549 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GBX1Q14549 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
GBX1Q14549 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
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GBX1Q14549 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GBX1Q14549 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GBX1Q14549 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GBX1Q14549 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
GBX1Q14549 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
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GBX1Q14549 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
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GBX1Q14549 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GBX1Q14549 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GBX1Q14549 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GBX1Q14549 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
GBX1Q14549 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GBX1Q14549 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
GBX1Q14549 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
GBX1Q14549 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
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GBX1Q14549 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
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GBX1Q14549 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
GBX1Q14549 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GBX1Q14549 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GBX1Q14549 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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GBX1Q14549 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GBX1Q14549 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GBX1Q14549 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GBX1Q14549 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GBX1Q14549 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GBX1Q14549 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GBX1Q14549 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GBX1Q14549 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GBX1Q14549 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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GBX1Q14549 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GBX1Q14549 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GBX1Q14549 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
GBX1Q14549 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GBX1Q14549 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GBX1Q14549 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
GBX1Q14549 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GBX1Q14549 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
GBX1Q14549 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GBX1Q14549 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
GBX1Q14549 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GBX1Q14549 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GBX1Q14549 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
GBX1Q14549 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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