Protein–RNA interactions for Protein: Q14524

SCN5A, Sodium channel protein type 5 subunit alpha, humanhuman

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Length 2,016 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN5AQ14524 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SCN5AQ14524 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
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