Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NEDD9Q14511 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NEDD9Q14511 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
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