Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CTTNQ14247 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CTTNQ14247 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CTTNQ14247 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CTTNQ14247 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CTTNQ14247 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CTTNQ14247 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CTTNQ14247 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CTTNQ14247 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CTTNQ14247 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CTTNQ14247 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CTTNQ14247 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CTTNQ14247 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CTTNQ14247 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
CTTNQ14247 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CTTNQ14247 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CTTNQ14247 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CTTNQ14247 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CTTNQ14247 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CTTNQ14247 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CTTNQ14247 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CTTNQ14247 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CTTNQ14247 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CTTNQ14247 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CTTNQ14247 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CTTNQ14247 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CTTNQ14247 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CTTNQ14247 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CTTNQ14247 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CTTNQ14247 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CTTNQ14247 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CTTNQ14247 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CTTNQ14247 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CTTNQ14247 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CTTNQ14247 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CTTNQ14247 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CTTNQ14247 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CTTNQ14247 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CTTNQ14247 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CTTNQ14247 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CTTNQ14247 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CTTNQ14247 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CTTNQ14247 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CTTNQ14247 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CTTNQ14247 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CTTNQ14247 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CTTNQ14247 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CTTNQ14247 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CTTNQ14247 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CTTNQ14247 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CTTNQ14247 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CTTNQ14247 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CTTNQ14247 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CTTNQ14247 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CTTNQ14247 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CTTNQ14247 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CTTNQ14247 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CTTNQ14247 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CTTNQ14247 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CTTNQ14247 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CTTNQ14247 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CTTNQ14247 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CTTNQ14247 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CTTNQ14247 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CTTNQ14247 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CTTNQ14247 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CTTNQ14247 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CTTNQ14247 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CTTNQ14247 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CTTNQ14247 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CTTNQ14247 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CTTNQ14247 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
CTTNQ14247 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CTTNQ14247 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CTTNQ14247 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CTTNQ14247 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CTTNQ14247 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CTTNQ14247 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CTTNQ14247 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CTTNQ14247 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CTTNQ14247 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CTTNQ14247 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
CTTNQ14247 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CTTNQ14247 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CTTNQ14247 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CTTNQ14247 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CTTNQ14247 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CTTNQ14247 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CTTNQ14247 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CTTNQ14247 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CTTNQ14247 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CTTNQ14247 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CTTNQ14247 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CTTNQ14247 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CTTNQ14247 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CTTNQ14247 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CTTNQ14247 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CTTNQ14247 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CTTNQ14247 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CTTNQ14247 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.5 ms