Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SCARB2Q14108 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SCARB2Q14108 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SCARB2Q14108 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SCARB2Q14108 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SCARB2Q14108 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SCARB2Q14108 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SCARB2Q14108 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SCARB2Q14108 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SCARB2Q14108 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SCARB2Q14108 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SCARB2Q14108 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SCARB2Q14108 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SCARB2Q14108 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SCARB2Q14108 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SCARB2Q14108 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SCARB2Q14108 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SCARB2Q14108 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SCARB2Q14108 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SCARB2Q14108 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SCARB2Q14108 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SCARB2Q14108 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SCARB2Q14108 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SCARB2Q14108 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SCARB2Q14108 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SCARB2Q14108 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SCARB2Q14108 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SCARB2Q14108 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SCARB2Q14108 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SCARB2Q14108 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SCARB2Q14108 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SCARB2Q14108 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SCARB2Q14108 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SCARB2Q14108 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SCARB2Q14108 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SCARB2Q14108 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SCARB2Q14108 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SCARB2Q14108 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
SCARB2Q14108 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SCARB2Q14108 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SCARB2Q14108 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SCARB2Q14108 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SCARB2Q14108 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SCARB2Q14108 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SCARB2Q14108 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SCARB2Q14108 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SCARB2Q14108 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SCARB2Q14108 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SCARB2Q14108 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SCARB2Q14108 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SCARB2Q14108 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
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SCARB2Q14108 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SCARB2Q14108 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SCARB2Q14108 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SCARB2Q14108 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SCARB2Q14108 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SCARB2Q14108 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SCARB2Q14108 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SCARB2Q14108 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SCARB2Q14108 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SCARB2Q14108 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
SCARB2Q14108 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SCARB2Q14108 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SCARB2Q14108 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SCARB2Q14108 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SCARB2Q14108 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SCARB2Q14108 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SCARB2Q14108 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
SCARB2Q14108 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SCARB2Q14108 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SCARB2Q14108 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SCARB2Q14108 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SCARB2Q14108 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
SCARB2Q14108 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC1.51□□□□□ -2.17
SCARB2Q14108 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SCARB2Q14108 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SCARB2Q14108 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SCARB2Q14108 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SCARB2Q14108 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SCARB2Q14108 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SCARB2Q14108 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SCARB2Q14108 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SCARB2Q14108 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SCARB2Q14108 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SCARB2Q14108 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SCARB2Q14108 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SCARB2Q14108 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SCARB2Q14108 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SCARB2Q14108 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SCARB2Q14108 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SCARB2Q14108 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SCARB2Q14108 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SCARB2Q14108 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SCARB2Q14108 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SCARB2Q14108 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SCARB2Q14108 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SCARB2Q14108 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
SCARB2Q14108 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SCARB2Q14108 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
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