Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CKAP5Q14008 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
CKAP5Q14008 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
CKAP5Q14008 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
CKAP5Q14008 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
CKAP5Q14008 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
CKAP5Q14008 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
CKAP5Q14008 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
CKAP5Q14008 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
CKAP5Q14008 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
CKAP5Q14008 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
CKAP5Q14008 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
CKAP5Q14008 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.04
CKAP5Q14008 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
CKAP5Q14008 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
CKAP5Q14008 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
CKAP5Q14008 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CKAP5Q14008 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CKAP5Q14008 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
CKAP5Q14008 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CKAP5Q14008 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CKAP5Q14008 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CKAP5Q14008 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CKAP5Q14008 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CKAP5Q14008 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CKAP5Q14008 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CKAP5Q14008 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CKAP5Q14008 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CKAP5Q14008 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CKAP5Q14008 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CKAP5Q14008 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CKAP5Q14008 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CKAP5Q14008 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CKAP5Q14008 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CKAP5Q14008 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CKAP5Q14008 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CKAP5Q14008 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CKAP5Q14008 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CKAP5Q14008 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CKAP5Q14008 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CKAP5Q14008 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CKAP5Q14008 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
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