Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CAPSQ13938 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CAPSQ13938 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CAPSQ13938 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CAPSQ13938 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CAPSQ13938 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CAPSQ13938 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
CAPSQ13938 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CAPSQ13938 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CAPSQ13938 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CAPSQ13938 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CAPSQ13938 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CAPSQ13938 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CAPSQ13938 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CAPSQ13938 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CAPSQ13938 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CAPSQ13938 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CAPSQ13938 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CAPSQ13938 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CAPSQ13938 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CAPSQ13938 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CAPSQ13938 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CAPSQ13938 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CAPSQ13938 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CAPSQ13938 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CAPSQ13938 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CAPSQ13938 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CAPSQ13938 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CAPSQ13938 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CAPSQ13938 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CAPSQ13938 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CAPSQ13938 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CAPSQ13938 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CAPSQ13938 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CAPSQ13938 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CAPSQ13938 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CAPSQ13938 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CAPSQ13938 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CAPSQ13938 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CAPSQ13938 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CAPSQ13938 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CAPSQ13938 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CAPSQ13938 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CAPSQ13938 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CAPSQ13938 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CAPSQ13938 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CAPSQ13938 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CAPSQ13938 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CAPSQ13938 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CAPSQ13938 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CAPSQ13938 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CAPSQ13938 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CAPSQ13938 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CAPSQ13938 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CAPSQ13938 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CAPSQ13938 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CAPSQ13938 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CAPSQ13938 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CAPSQ13938 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CAPSQ13938 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CAPSQ13938 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CAPSQ13938 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CAPSQ13938 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CAPSQ13938 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CAPSQ13938 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CAPSQ13938 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CAPSQ13938 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CAPSQ13938 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CAPSQ13938 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CAPSQ13938 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CAPSQ13938 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CAPSQ13938 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CAPSQ13938 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CAPSQ13938 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CAPSQ13938 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CAPSQ13938 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CAPSQ13938 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CAPSQ13938 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CAPSQ13938 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CAPSQ13938 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CAPSQ13938 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CAPSQ13938 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CAPSQ13938 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CAPSQ13938 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CAPSQ13938 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CAPSQ13938 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CAPSQ13938 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CAPSQ13938 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CAPSQ13938 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CAPSQ13938 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
CAPSQ13938 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CAPSQ13938 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CAPSQ13938 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CAPSQ13938 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CAPSQ13938 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CAPSQ13938 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CAPSQ13938 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CAPSQ13938 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CAPSQ13938 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CAPSQ13938 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101 ms