Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
ATP1A4Q13733 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ATP1A4Q13733 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ATP1A4Q13733 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
ATP1A4Q13733 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ATP1A4Q13733 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ATP1A4Q13733 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
ATP1A4Q13733 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ATP1A4Q13733 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ATP1A4Q13733 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
ATP1A4Q13733 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ATP1A4Q13733 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
ATP1A4Q13733 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ATP1A4Q13733 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ATP1A4Q13733 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ATP1A4Q13733 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ATP1A4Q13733 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ATP1A4Q13733 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ATP1A4Q13733 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
ATP1A4Q13733 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
ATP1A4Q13733 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
ATP1A4Q13733 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
ATP1A4Q13733 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ATP1A4Q13733 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ATP1A4Q13733 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ATP1A4Q13733 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ATP1A4Q13733 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ATP1A4Q13733 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
ATP1A4Q13733 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ATP1A4Q13733 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ATP1A4Q13733 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ATP1A4Q13733 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
ATP1A4Q13733 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
ATP1A4Q13733 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ATP1A4Q13733 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ATP1A4Q13733 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
ATP1A4Q13733 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
ATP1A4Q13733 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
ATP1A4Q13733 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
ATP1A4Q13733 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
ATP1A4Q13733 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ATP1A4Q13733 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
ATP1A4Q13733 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
ATP1A4Q13733 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ATP1A4Q13733 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ATP1A4Q13733 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ATP1A4Q13733 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
ATP1A4Q13733 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ATP1A4Q13733 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ATP1A4Q13733 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ATP1A4Q13733 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ATP1A4Q13733 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
ATP1A4Q13733 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.43□□□□□ -2.02
ATP1A4Q13733 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ATP1A4Q13733 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
ATP1A4Q13733 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
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