Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CDH18Q13634 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
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