Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
SF3B2Q13435 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SF3B2Q13435 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SF3B2Q13435 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SF3B2Q13435 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SF3B2Q13435 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SF3B2Q13435 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SF3B2Q13435 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SF3B2Q13435 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SF3B2Q13435 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SF3B2Q13435 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SF3B2Q13435 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SF3B2Q13435 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SF3B2Q13435 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SF3B2Q13435 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SF3B2Q13435 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SF3B2Q13435 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SF3B2Q13435 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
SF3B2Q13435 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SF3B2Q13435 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SF3B2Q13435 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SF3B2Q13435 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SF3B2Q13435 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SF3B2Q13435 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SF3B2Q13435 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SF3B2Q13435 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SF3B2Q13435 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
SF3B2Q13435 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SF3B2Q13435 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SF3B2Q13435 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SF3B2Q13435 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SF3B2Q13435 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SF3B2Q13435 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SF3B2Q13435 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SF3B2Q13435 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SF3B2Q13435 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SF3B2Q13435 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SF3B2Q13435 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SF3B2Q13435 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SF3B2Q13435 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SF3B2Q13435 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SF3B2Q13435 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SF3B2Q13435 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SF3B2Q13435 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SF3B2Q13435 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SF3B2Q13435 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SF3B2Q13435 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
SF3B2Q13435 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SF3B2Q13435 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SF3B2Q13435 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SF3B2Q13435 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
SF3B2Q13435 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
SF3B2Q13435 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SF3B2Q13435 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SF3B2Q13435 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SF3B2Q13435 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SF3B2Q13435 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SF3B2Q13435 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SF3B2Q13435 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SF3B2Q13435 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SF3B2Q13435 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
SF3B2Q13435 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SF3B2Q13435 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SF3B2Q13435 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SF3B2Q13435 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SF3B2Q13435 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SF3B2Q13435 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SF3B2Q13435 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SF3B2Q13435 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SF3B2Q13435 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SF3B2Q13435 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SF3B2Q13435 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SF3B2Q13435 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
SF3B2Q13435 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SF3B2Q13435 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
SF3B2Q13435 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
SF3B2Q13435 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
SF3B2Q13435 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SF3B2Q13435 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
SF3B2Q13435 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SF3B2Q13435 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SF3B2Q13435 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SF3B2Q13435 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SF3B2Q13435 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SF3B2Q13435 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SF3B2Q13435 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SF3B2Q13435 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SF3B2Q13435 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SF3B2Q13435 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SF3B2Q13435 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SF3B2Q13435 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SF3B2Q13435 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SF3B2Q13435 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SF3B2Q13435 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SF3B2Q13435 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SF3B2Q13435 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SF3B2Q13435 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SF3B2Q13435 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SF3B2Q13435 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SF3B2Q13435 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
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