Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
TCOF1Q13428 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
TCOF1Q13428 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
TCOF1Q13428 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
TCOF1Q13428 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
TCOF1Q13428 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
TCOF1Q13428 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
TCOF1Q13428 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
TCOF1Q13428 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
TCOF1Q13428 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
TCOF1Q13428 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
TCOF1Q13428 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
TCOF1Q13428 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
TCOF1Q13428 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
TCOF1Q13428 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
TCOF1Q13428 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
TCOF1Q13428 AL163973.2-201ENST00000548096 288 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
TCOF1Q13428 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
TCOF1Q13428 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
TCOF1Q13428 AC126544.2-201ENST00000625174 749 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
TCOF1Q13428 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
TCOF1Q13428 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
TCOF1Q13428 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
TCOF1Q13428 SNORD116-12-201ENST00000384468 92 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
TCOF1Q13428 MIR214-201ENST00000385214 110 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
TCOF1Q13428 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
TCOF1Q13428 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
TCOF1Q13428 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
TCOF1Q13428 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
TCOF1Q13428 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
TCOF1Q13428 AL354692.1-201ENST00000423044 315 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
TCOF1Q13428 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
TCOF1Q13428 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
TCOF1Q13428 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
TCOF1Q13428 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
TCOF1Q13428 AC130371.1-204ENST00000576197 401 ntTSL 3 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
TCOF1Q13428 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
TCOF1Q13428 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
TCOF1Q13428 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
TCOF1Q13428 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
TCOF1Q13428 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
TCOF1Q13428 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
TCOF1Q13428 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
TCOF1Q13428 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
TCOF1Q13428 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
TCOF1Q13428 AL158042.1-201ENST00000605338 460 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
TCOF1Q13428 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
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TCOF1Q13428 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.1□□□□□ -2.42
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TCOF1Q13428 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC-0.1□□□□□ -2.42
TCOF1Q13428 XIRP2-AS1-201ENST00000525330 776 ntTSL 3 BASIC-0.1□□□□□ -2.42
TCOF1Q13428 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
TCOF1Q13428 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
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TCOF1Q13428 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
TCOF1Q13428 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
TCOF1Q13428 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
TCOF1Q13428 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
TCOF1Q13428 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
TCOF1Q13428 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
TCOF1Q13428 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
TCOF1Q13428 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC-0.1□□□□□ -2.43
TCOF1Q13428 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
TCOF1Q13428 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
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