Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.47□□□□□ -2.33
PTPRSQ13332 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRSQ13332 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRSQ13332 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRSQ13332 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRSQ13332 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRSQ13332 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRSQ13332 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRSQ13332 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRSQ13332 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRSQ13332 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRSQ13332 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRSQ13332 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRSQ13332 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRSQ13332 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRSQ13332 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRSQ13332 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRSQ13332 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRSQ13332 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRSQ13332 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRSQ13332 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRSQ13332 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRSQ13332 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRSQ13332 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRSQ13332 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRSQ13332 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRSQ13332 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRSQ13332 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRSQ13332 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRSQ13332 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRSQ13332 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRSQ13332 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PTPRSQ13332 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPRSQ13332 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPRSQ13332 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPRSQ13332 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPRSQ13332 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPRSQ13332 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPRSQ13332 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPRSQ13332 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPRSQ13332 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPRSQ13332 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPRSQ13332 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPRSQ13332 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPRSQ13332 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPRSQ13332 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPRSQ13332 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPRSQ13332 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPRSQ13332 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPRSQ13332 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPRSQ13332 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPRSQ13332 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPRSQ13332 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPRSQ13332 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
PTPRSQ13332 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPRSQ13332 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPRSQ13332 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPRSQ13332 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPRSQ13332 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPRSQ13332 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPRSQ13332 AC008147.1-201ENST00000551284 325 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPRSQ13332 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPRSQ13332 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPRSQ13332 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPRSQ13332 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPRSQ13332 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPRSQ13332 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPRSQ13332 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPRSQ13332 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPRSQ13332 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPRSQ13332 RNU6-311P-201ENST00000516224 102 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPRSQ13332 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPRSQ13332 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPRSQ13332 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPRSQ13332 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPRSQ13332 BNIP3P39-201ENST00000601077 554 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PTPRSQ13332 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPRSQ13332 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPRSQ13332 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPRSQ13332 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPRSQ13332 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPRSQ13332 RNU6-925P-201ENST00000384629 104 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPRSQ13332 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPRSQ13332 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPRSQ13332 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPRSQ13332 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPRSQ13332 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPRSQ13332 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPRSQ13332 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPRSQ13332 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPRSQ13332 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPRSQ13332 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPRSQ13332 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPRSQ13332 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPRSQ13332 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PTPRSQ13332 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPRSQ13332 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPRSQ13332 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPRSQ13332 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PTPRSQ13332 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.5 ms