Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 TMEM67-202ENST00000409623 3255 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 IQCH-206ENST00000546225 3112 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 DDX60L-209ENST00000511577 6781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 LINC01733-201ENST00000449316 4604 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 TLR8-202ENST00000311912 3367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 RN7SKP167-201ENST00000411047 285 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 ABCC9-201ENST00000261200 8293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 DOCK7-219ENST00000635253 6423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 Z82217.1-201ENST00000625157 8149 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 AC024940.1-203ENST00000398963 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 DMD-230ENST00000620040 13746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 SNORD74.4-201ENST00000364129 80 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 RPS26P28-201ENST00000470806 348 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 PPIAP15-201ENST00000479662 484 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 MIR2114-201ENST00000516645 80 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 PCDH11X-206ENST00000373097 9146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 FAM169A-201ENST00000389156 5990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 RPL29P14-201ENST00000495837 428 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 AC025627.2-201ENST00000576220 160 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 CNOT10-206ENST00000454516 2760 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CLN3Q13286 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 AC020914.4-201ENST00000597690 277 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 ABCF2P2-201ENST00000450549 296 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CLN3Q13286 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
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