Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ERCC8Q13216 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ERCC8Q13216 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
ERCC8Q13216 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
ERCC8Q13216 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ERCC8Q13216 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ERCC8Q13216 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ERCC8Q13216 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ERCC8Q13216 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ERCC8Q13216 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ERCC8Q13216 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ERCC8Q13216 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
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ERCC8Q13216 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
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ERCC8Q13216 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ERCC8Q13216 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ERCC8Q13216 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
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ERCC8Q13216 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ERCC8Q13216 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ERCC8Q13216 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ERCC8Q13216 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ERCC8Q13216 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
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ERCC8Q13216 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
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ERCC8Q13216 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
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ERCC8Q13216 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ERCC8Q13216 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
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ERCC8Q13216 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
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ERCC8Q13216 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ERCC8Q13216 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ERCC8Q13216 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ERCC8Q13216 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ERCC8Q13216 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
ERCC8Q13216 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ERCC8Q13216 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ERCC8Q13216 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ERCC8Q13216 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ERCC8Q13216 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ERCC8Q13216 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
ERCC8Q13216 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
ERCC8Q13216 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ERCC8Q13216 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ERCC8Q13216 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ERCC8Q13216 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ERCC8Q13216 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ERCC8Q13216 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ERCC8Q13216 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ERCC8Q13216 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ERCC8Q13216 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
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