Protein–RNA interactions for Protein: Q13206

DDX10, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX10Q13206 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
DDX10Q13206 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
DDX10Q13206 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
DDX10Q13206 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
DDX10Q13206 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
DDX10Q13206 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
DDX10Q13206 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
DDX10Q13206 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
DDX10Q13206 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
DDX10Q13206 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
DDX10Q13206 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
DDX10Q13206 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
DDX10Q13206 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
DDX10Q13206 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
DDX10Q13206 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
DDX10Q13206 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
DDX10Q13206 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
DDX10Q13206 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
DDX10Q13206 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
DDX10Q13206 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
DDX10Q13206 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
DDX10Q13206 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
DDX10Q13206 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
DDX10Q13206 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
DDX10Q13206 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
DDX10Q13206 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
DDX10Q13206 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
DDX10Q13206 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
DDX10Q13206 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
DDX10Q13206 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
DDX10Q13206 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
DDX10Q13206 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
DDX10Q13206 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
DDX10Q13206 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
DDX10Q13206 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
DDX10Q13206 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
DDX10Q13206 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
DDX10Q13206 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
DDX10Q13206 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
DDX10Q13206 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
DDX10Q13206 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
DDX10Q13206 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
DDX10Q13206 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
DDX10Q13206 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
DDX10Q13206 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
DDX10Q13206 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
DDX10Q13206 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
DDX10Q13206 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
DDX10Q13206 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
DDX10Q13206 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
DDX10Q13206 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
DDX10Q13206 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
DDX10Q13206 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
DDX10Q13206 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
DDX10Q13206 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
DDX10Q13206 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
DDX10Q13206 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
DDX10Q13206 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
DDX10Q13206 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
DDX10Q13206 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
DDX10Q13206 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
DDX10Q13206 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
DDX10Q13206 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC2.05□□□□□ -2.08
DDX10Q13206 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
DDX10Q13206 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
DDX10Q13206 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
DDX10Q13206 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
DDX10Q13206 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
DDX10Q13206 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
DDX10Q13206 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
DDX10Q13206 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
DDX10Q13206 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
DDX10Q13206 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
DDX10Q13206 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
DDX10Q13206 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
DDX10Q13206 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
DDX10Q13206 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
DDX10Q13206 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
DDX10Q13206 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
DDX10Q13206 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
DDX10Q13206 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
DDX10Q13206 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
DDX10Q13206 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
DDX10Q13206 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
DDX10Q13206 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
DDX10Q13206 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
DDX10Q13206 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
DDX10Q13206 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
DDX10Q13206 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
DDX10Q13206 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
DDX10Q13206 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
DDX10Q13206 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
DDX10Q13206 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
DDX10Q13206 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
DDX10Q13206 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
DDX10Q13206 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
DDX10Q13206 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
DDX10Q13206 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
DDX10Q13206 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
DDX10Q13206 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.03□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.4 ms