Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
CHAF1BQ13112 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CHAF1BQ13112 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
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