Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
CHAF1AQ13111 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CHAF1AQ13111 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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