Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC-0.75□□□□□ -2.53
BPTFQ12830 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC-0.75□□□□□ -2.53
BPTFQ12830 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
BPTFQ12830 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
BPTFQ12830 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC-0.75□□□□□ -2.53
BPTFQ12830 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
BPTFQ12830 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
BPTFQ12830 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC-0.76□□□□□ -2.53
BPTFQ12830 SNORD116-30-201ENST00000516468 85 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
BPTFQ12830 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
BPTFQ12830 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
BPTFQ12830 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
BPTFQ12830 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
BPTFQ12830 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC-0.76□□□□□ -2.53
BPTFQ12830 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
BPTFQ12830 MIR6514-201ENST00000622549 70 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
BPTFQ12830 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC-0.76□□□□□ -2.53
BPTFQ12830 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
BPTFQ12830 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
BPTFQ12830 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
BPTFQ12830 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
BPTFQ12830 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
BPTFQ12830 Y_RNA.484-201ENST00000384389 103 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
BPTFQ12830 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC-0.77□□□□□ -2.53
BPTFQ12830 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC-0.77□□□□□ -2.53
BPTFQ12830 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
BPTFQ12830 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
BPTFQ12830 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC-0.77□□□□□ -2.53
BPTFQ12830 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
BPTFQ12830 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
BPTFQ12830 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
BPTFQ12830 AC242426.3-203ENST00000606757 712 ntTSL 3 BASIC-0.78□□□□□ -2.53
BPTFQ12830 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
BPTFQ12830 AC104820.1-201ENST00000624183 307 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
BPTFQ12830 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
BPTFQ12830 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
BPTFQ12830 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC-0.78□□□□□ -2.53
BPTFQ12830 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
BPTFQ12830 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
BPTFQ12830 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC-0.78□□□□□ -2.53
BPTFQ12830 RNA5SP163-201ENST00000410304 99 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
BPTFQ12830 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
BPTFQ12830 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
BPTFQ12830 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
BPTFQ12830 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC-0.78□□□□□ -2.53
BPTFQ12830 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
BPTFQ12830 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
BPTFQ12830 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
BPTFQ12830 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
BPTFQ12830 Y_RNA.284-201ENST00000364806 102 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
BPTFQ12830 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
BPTFQ12830 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
BPTFQ12830 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC-0.79□□□□□ -2.54
BPTFQ12830 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
BPTFQ12830 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
BPTFQ12830 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
BPTFQ12830 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC-0.79□□□□□ -2.54
BPTFQ12830 MTND3P4-201ENST00000453537 303 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
BPTFQ12830 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC-0.79□□□□□ -2.54
BPTFQ12830 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
BPTFQ12830 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
BPTFQ12830 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
BPTFQ12830 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
BPTFQ12830 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
BPTFQ12830 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
BPTFQ12830 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
BPTFQ12830 RPL31P54-201ENST00000429803 370 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
BPTFQ12830 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC-0.8□□□□□ -2.54
BPTFQ12830 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC-0.8□□□□□ -2.54
BPTFQ12830 AL133217.1-201ENST00000450980 425 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
BPTFQ12830 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
BPTFQ12830 SMAD5-AS1_3.1-201ENST00000614187 124 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
BPTFQ12830 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
BPTFQ12830 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
BPTFQ12830 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
BPTFQ12830 AC110760.3-202ENST00000515177 371 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
BPTFQ12830 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
BPTFQ12830 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
BPTFQ12830 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
BPTFQ12830 LINC01609-201ENST00000519506 424 ntTSL 3 BASIC-0.81□□□□□ -2.54
BPTFQ12830 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC-0.81□□□□□ -2.54
BPTFQ12830 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
BPTFQ12830 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
BPTFQ12830 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
BPTFQ12830 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
BPTFQ12830 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
BPTFQ12830 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
BPTFQ12830 AC027544.2-201ENST00000539313 630 ntTSL 5 BASIC-0.81□□□□□ -2.54
BPTFQ12830 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
BPTFQ12830 MIR4520-1-201ENST00000582609 70 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
BPTFQ12830 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
BPTFQ12830 MIR6502-201ENST00000617296 76 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
BPTFQ12830 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
BPTFQ12830 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
BPTFQ12830 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
BPTFQ12830 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC-0.81□□□□□ -2.54
BPTFQ12830 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
BPTFQ12830 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
BPTFQ12830 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
BPTFQ12830 MTND4P21-201ENST00000453886 1357 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 179.1 ms