Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SMARCB1Q12824 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SMARCB1Q12824 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SMARCB1Q12824 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SMARCB1Q12824 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SMARCB1Q12824 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SMARCB1Q12824 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.23□□□□□ -2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.1 ms