Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
FOXO1Q12778 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
FOXO1Q12778 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
FOXO1Q12778 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC2.31□□□□□ -2.04
FOXO1Q12778 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
FOXO1Q12778 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
FOXO1Q12778 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC2.31□□□□□ -2.04
FOXO1Q12778 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
FOXO1Q12778 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
FOXO1Q12778 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
FOXO1Q12778 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
FOXO1Q12778 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
FOXO1Q12778 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
FOXO1Q12778 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
FOXO1Q12778 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
FOXO1Q12778 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
FOXO1Q12778 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
FOXO1Q12778 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
FOXO1Q12778 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
FOXO1Q12778 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
FOXO1Q12778 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
FOXO1Q12778 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
FOXO1Q12778 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
FOXO1Q12778 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
FOXO1Q12778 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
FOXO1Q12778 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
FOXO1Q12778 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
FOXO1Q12778 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
FOXO1Q12778 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
FOXO1Q12778 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
FOXO1Q12778 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
FOXO1Q12778 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
FOXO1Q12778 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
FOXO1Q12778 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
FOXO1Q12778 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
FOXO1Q12778 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
FOXO1Q12778 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
FOXO1Q12778 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
FOXO1Q12778 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
FOXO1Q12778 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
FOXO1Q12778 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
FOXO1Q12778 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
FOXO1Q12778 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
FOXO1Q12778 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
FOXO1Q12778 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
FOXO1Q12778 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
FOXO1Q12778 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
FOXO1Q12778 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
FOXO1Q12778 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
FOXO1Q12778 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
FOXO1Q12778 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
FOXO1Q12778 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
FOXO1Q12778 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
FOXO1Q12778 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
FOXO1Q12778 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
FOXO1Q12778 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
FOXO1Q12778 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
FOXO1Q12778 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
FOXO1Q12778 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
FOXO1Q12778 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.04
FOXO1Q12778 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
FOXO1Q12778 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
FOXO1Q12778 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
FOXO1Q12778 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
FOXO1Q12778 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
FOXO1Q12778 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
FOXO1Q12778 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
FOXO1Q12778 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
FOXO1Q12778 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
FOXO1Q12778 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
FOXO1Q12778 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC2.28□□□□□ -2.05
FOXO1Q12778 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
FOXO1Q12778 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
FOXO1Q12778 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
FOXO1Q12778 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
FOXO1Q12778 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
FOXO1Q12778 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
FOXO1Q12778 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
FOXO1Q12778 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
FOXO1Q12778 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
FOXO1Q12778 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
FOXO1Q12778 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
FOXO1Q12778 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
FOXO1Q12778 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
FOXO1Q12778 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
FOXO1Q12778 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
FOXO1Q12778 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
FOXO1Q12778 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
FOXO1Q12778 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXO1Q12778 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXO1Q12778 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXO1Q12778 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXO1Q12778 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXO1Q12778 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXO1Q12778 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXO1Q12778 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXO1Q12778 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXO1Q12778 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXO1Q12778 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXO1Q12778 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms