Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
CENPFP49454 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC-1.65□□□□□ -2.67
CENPFP49454 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
CENPFP49454 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
CENPFP49454 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
CENPFP49454 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
CENPFP49454 LINC00871-202ENST00000556071 554 ntTSL 3 BASIC-1.65□□□□□ -2.67
CENPFP49454 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
CENPFP49454 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
CENPFP49454 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
CENPFP49454 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC-1.65□□□□□ -2.67
CENPFP49454 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
CENPFP49454 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
CENPFP49454 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
CENPFP49454 AL158053.1-201ENST00000441503 453 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
CENPFP49454 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
CENPFP49454 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
CENPFP49454 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
CENPFP49454 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
CENPFP49454 AC027449.1-201ENST00000608890 407 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
CENPFP49454 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.67
CENPFP49454 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.67
CENPFP49454 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.67
CENPFP49454 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.67
CENPFP49454 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC-1.66□□□□□ -2.67
CENPFP49454 AC018926.1-201ENST00000616335 435 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.67
CENPFP49454 AC132825.8-201ENST00000640783 297 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.67
CENPFP49454 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC-1.66□□□□□ -2.68
CENPFP49454 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
CENPFP49454 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
CENPFP49454 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
CENPFP49454 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
CENPFP49454 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
CENPFP49454 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
CENPFP49454 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
CENPFP49454 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
CENPFP49454 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
CENPFP49454 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
CENPFP49454 RNU7-134P-201ENST00000458997 64 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
CENPFP49454 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
CENPFP49454 RNA5SP405-201ENST00000363059 114 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
CENPFP49454 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC-1.67□□□□□ -2.68
CENPFP49454 RNU7-157P-201ENST00000459600 66 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
CENPFP49454 AC009268.1-201ENST00000561352 1203 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
CENPFP49454 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
CENPFP49454 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
CENPFP49454 CEP70-205ENST00000464035 1054 ntTSL 1 (best) BASIC-1.67□□□□□ -2.68
CENPFP49454 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC-1.67□□□□□ -2.68
CENPFP49454 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
CENPFP49454 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
CENPFP49454 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
CENPFP49454 RNA5SP86-201ENST00000390869 98 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
CENPFP49454 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
CENPFP49454 AL358176.1-201ENST00000457477 357 ntTSL 5 BASIC-1.68□□□□□ -2.68
CENPFP49454 AC016993.1-201ENST00000547033 1258 ntTSL 3 BASIC-1.68□□□□□ -2.68
CENPFP49454 AC130415.1-201ENST00000547569 1010 ntTSL 4 BASIC-1.68□□□□□ -2.68
CENPFP49454 AC100781.1-202ENST00000597906 463 ntTSL 5 BASIC-1.68□□□□□ -2.68
CENPFP49454 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
CENPFP49454 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
CENPFP49454 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
CENPFP49454 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC-1.68□□□□□ -2.68
CENPFP49454 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
CENPFP49454 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
CENPFP49454 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
CENPFP49454 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
CENPFP49454 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
CENPFP49454 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
CENPFP49454 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
CENPFP49454 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
CENPFP49454 AC113423.1-201ENST00000523279 289 ntTSL 3 BASIC-1.69□□□□□ -2.68
CENPFP49454 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC-1.69□□□□□ -2.68
CENPFP49454 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
CENPFP49454 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
CENPFP49454 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
CENPFP49454 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC-1.69□□□□□ -2.68
CENPFP49454 AC104820.1-201ENST00000624183 307 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
CENPFP49454 RNU6-194P-201ENST00000363862 105 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
CENPFP49454 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
CENPFP49454 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC-1.7□□□□□ -2.68
CENPFP49454 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
CENPFP49454 AC108019.1-201ENST00000512540 175 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
CENPFP49454 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
CENPFP49454 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
CENPFP49454 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC-1.7□□□□□ -2.68
CENPFP49454 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC-1.7□□□□□ -2.68
CENPFP49454 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
CENPFP49454 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
CENPFP49454 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
CENPFP49454 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
CENPFP49454 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
CENPFP49454 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
CENPFP49454 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC-1.7□□□□□ -2.68
CENPFP49454 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
CENPFP49454 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC-1.7□□□□□ -2.68
CENPFP49454 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
CENPFP49454 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
CENPFP49454 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC-1.7□□□□□ -2.68
CENPFP49454 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC-1.71□□□□□ -2.68
CENPFP49454 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC-1.71□□□□□ -2.68
CENPFP49454 Y_RNA.678-201ENST00000516408 96 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.4 ms