Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PTPRDP23468 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PTPRDP23468 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PTPRDP23468 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC0.02□□□□□ -2.41
PTPRDP23468 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PTPRDP23468 RNU6-276P-201ENST00000516114 96 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PTPRDP23468 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PTPRDP23468 MIR4636-201ENST00000582271 80 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PTPRDP23468 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC0.02□□□□□ -2.41
PTPRDP23468 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PTPRDP23468 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPRDP23468 Y_RNA.110-201ENST00000363220 99 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPRDP23468 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPRDP23468 RNU2-72P-201ENST00000411175 163 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPRDP23468 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPRDP23468 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPRDP23468 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPRDP23468 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPRDP23468 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPRDP23468 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPRDP23468 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPRDP23468 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPRDP23468 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPRDP23468 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPRDP23468 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPRDP23468 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPRDP23468 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPRDP23468 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPRDP23468 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPRDP23468 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPRDP23468 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPRDP23468 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPRDP23468 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPRDP23468 ZNF736P4Y-201ENST00000454995 1243 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPRDP23468 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPRDP23468 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPRDP23468 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPRDP23468 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPRDP23468 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPRDP23468 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPRDP23468 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC0□□□□□ -2.41
PTPRDP23468 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
PTPRDP23468 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC0□□□□□ -2.41
PTPRDP23468 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC0□□□□□ -2.41
PTPRDP23468 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC0□□□□□ -2.41
PTPRDP23468 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC0□□□□□ -2.41
PTPRDP23468 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC0□□□□□ -2.41
PTPRDP23468 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC0□□□□□ -2.41
PTPRDP23468 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC0□□□□□ -2.41
PTPRDP23468 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC0□□□□□ -2.41
PTPRDP23468 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC0□□□□□ -2.41
PTPRDP23468 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC0□□□□□ -2.41
PTPRDP23468 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC0□□□□□ -2.41
PTPRDP23468 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC0□□□□□ -2.41
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PTPRDP23468 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC0□□□□□ -2.41
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PTPRDP23468 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC0□□□□□ -2.41
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PTPRDP23468 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
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PTPRDP23468 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
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PTPRDP23468 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
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PTPRDP23468 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
PTPRDP23468 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
PTPRDP23468 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PTPRDP23468 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PTPRDP23468 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PTPRDP23468 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PTPRDP23468 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
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PTPRDP23468 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PTPRDP23468 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PTPRDP23468 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
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