Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 BNIP3P39-201ENST00000601077 554 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC0.51□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
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PTPRBP23467 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
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PTPRBP23467 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
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PTPRBP23467 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
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PTPRBP23467 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 AL022161.1-201ENST00000604390 213 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 AC022306.3-201ENST00000619930 550 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.49□□□□□ -2.33
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PTPRBP23467 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
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PTPRBP23467 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 AC008568.1-203ENST00000433406 765 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC0.49□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PTPRBP23467 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
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