Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CTIFO43310 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CTIFO43310 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CTIFO43310 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
CTIFO43310 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CTIFO43310 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
CTIFO43310 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CTIFO43310 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CTIFO43310 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CTIFO43310 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CTIFO43310 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CTIFO43310 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CTIFO43310 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CTIFO43310 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CTIFO43310 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CTIFO43310 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CTIFO43310 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CTIFO43310 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CTIFO43310 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CTIFO43310 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CTIFO43310 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CTIFO43310 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CTIFO43310 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CTIFO43310 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CTIFO43310 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CTIFO43310 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CTIFO43310 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CTIFO43310 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CTIFO43310 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CTIFO43310 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CTIFO43310 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
CTIFO43310 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
CTIFO43310 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC2.59□□□□□ -2
CTIFO43310 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CTIFO43310 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CTIFO43310 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CTIFO43310 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CTIFO43310 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CTIFO43310 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CTIFO43310 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CTIFO43310 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CTIFO43310 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CTIFO43310 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CTIFO43310 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CTIFO43310 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CTIFO43310 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CTIFO43310 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CTIFO43310 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CTIFO43310 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CTIFO43310 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CTIFO43310 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CTIFO43310 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CTIFO43310 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CTIFO43310 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CTIFO43310 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CTIFO43310 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CTIFO43310 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
CTIFO43310 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
CTIFO43310 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CTIFO43310 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CTIFO43310 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CTIFO43310 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CTIFO43310 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CTIFO43310 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CTIFO43310 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CTIFO43310 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CTIFO43310 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CTIFO43310 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CTIFO43310 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CTIFO43310 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CTIFO43310 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CTIFO43310 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CTIFO43310 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CTIFO43310 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CTIFO43310 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CTIFO43310 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CTIFO43310 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
CTIFO43310 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CTIFO43310 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CTIFO43310 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
CTIFO43310 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CTIFO43310 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CTIFO43310 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CTIFO43310 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CTIFO43310 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CTIFO43310 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CTIFO43310 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CTIFO43310 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CTIFO43310 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CTIFO43310 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
CTIFO43310 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CTIFO43310 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CTIFO43310 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CTIFO43310 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CTIFO43310 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CTIFO43310 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CTIFO43310 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CTIFO43310 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CTIFO43310 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CTIFO43310 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150.1 ms