Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

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Length 73 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
J3KRW8 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
J3KRW8 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
J3KRW8 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.1
J3KRW8 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
J3KRW8 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
J3KRW8 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
J3KRW8 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
J3KRW8 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
J3KRW8 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
J3KRW8 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC1.9□□□□□ -2.11
J3KRW8 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
J3KRW8 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
J3KRW8 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
J3KRW8 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
J3KRW8 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
J3KRW8 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
J3KRW8 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
J3KRW8 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
J3KRW8 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
J3KRW8 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
J3KRW8 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
J3KRW8 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
J3KRW8 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
J3KRW8 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
J3KRW8 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
J3KRW8 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
J3KRW8 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
J3KRW8 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
J3KRW8 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
J3KRW8 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
J3KRW8 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
J3KRW8 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
J3KRW8 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
J3KRW8 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
J3KRW8 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
J3KRW8 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
J3KRW8 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
J3KRW8 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
J3KRW8 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
J3KRW8 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
J3KRW8 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
J3KRW8 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
J3KRW8 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
J3KRW8 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
J3KRW8 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
J3KRW8 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
J3KRW8 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
J3KRW8 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
J3KRW8 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
J3KRW8 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
J3KRW8 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
J3KRW8 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
J3KRW8 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
J3KRW8 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
J3KRW8 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
J3KRW8 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
J3KRW8 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
J3KRW8 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
J3KRW8 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
J3KRW8 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
J3KRW8 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
J3KRW8 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
J3KRW8 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
J3KRW8 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
J3KRW8 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
J3KRW8 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
J3KRW8 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
J3KRW8 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
J3KRW8 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
J3KRW8 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
J3KRW8 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
J3KRW8 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
J3KRW8 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
J3KRW8 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
J3KRW8 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
J3KRW8 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
J3KRW8 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
J3KRW8 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
J3KRW8 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
J3KRW8 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
J3KRW8 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
J3KRW8 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
J3KRW8 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
J3KRW8 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
J3KRW8 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
J3KRW8 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
J3KRW8 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
J3KRW8 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC1.87□□□□□ -2.11
J3KRW8 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
J3KRW8 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
J3KRW8 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.86□□□□□ -2.11
J3KRW8 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
J3KRW8 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
J3KRW8 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
J3KRW8 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
J3KRW8 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
J3KRW8 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
J3KRW8 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
J3KRW8 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
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