Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
SHOC2Q9UQ13 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SHOC2Q9UQ13 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SHOC2Q9UQ13 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SHOC2Q9UQ13 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SHOC2Q9UQ13 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SHOC2Q9UQ13 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SHOC2Q9UQ13 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SHOC2Q9UQ13 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SHOC2Q9UQ13 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SHOC2Q9UQ13 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SHOC2Q9UQ13 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SHOC2Q9UQ13 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SHOC2Q9UQ13 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SHOC2Q9UQ13 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SHOC2Q9UQ13 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SHOC2Q9UQ13 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SHOC2Q9UQ13 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SHOC2Q9UQ13 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SHOC2Q9UQ13 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SHOC2Q9UQ13 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SHOC2Q9UQ13 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SHOC2Q9UQ13 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SHOC2Q9UQ13 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SHOC2Q9UQ13 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SHOC2Q9UQ13 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SHOC2Q9UQ13 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SHOC2Q9UQ13 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SHOC2Q9UQ13 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SHOC2Q9UQ13 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SHOC2Q9UQ13 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SHOC2Q9UQ13 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SHOC2Q9UQ13 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SHOC2Q9UQ13 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SHOC2Q9UQ13 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SHOC2Q9UQ13 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SHOC2Q9UQ13 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SHOC2Q9UQ13 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SHOC2Q9UQ13 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SHOC2Q9UQ13 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SHOC2Q9UQ13 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SHOC2Q9UQ13 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SHOC2Q9UQ13 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SHOC2Q9UQ13 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SHOC2Q9UQ13 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SHOC2Q9UQ13 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
SHOC2Q9UQ13 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SHOC2Q9UQ13 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SHOC2Q9UQ13 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SHOC2Q9UQ13 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SHOC2Q9UQ13 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SHOC2Q9UQ13 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SHOC2Q9UQ13 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SHOC2Q9UQ13 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SHOC2Q9UQ13 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SHOC2Q9UQ13 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SHOC2Q9UQ13 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SHOC2Q9UQ13 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SHOC2Q9UQ13 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SHOC2Q9UQ13 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SHOC2Q9UQ13 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
SHOC2Q9UQ13 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SHOC2Q9UQ13 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SHOC2Q9UQ13 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
SHOC2Q9UQ13 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SHOC2Q9UQ13 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SHOC2Q9UQ13 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SHOC2Q9UQ13 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SHOC2Q9UQ13 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SHOC2Q9UQ13 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SHOC2Q9UQ13 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SHOC2Q9UQ13 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SHOC2Q9UQ13 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SHOC2Q9UQ13 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SHOC2Q9UQ13 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SHOC2Q9UQ13 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SHOC2Q9UQ13 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SHOC2Q9UQ13 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SHOC2Q9UQ13 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SHOC2Q9UQ13 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SHOC2Q9UQ13 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SHOC2Q9UQ13 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SHOC2Q9UQ13 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SHOC2Q9UQ13 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SHOC2Q9UQ13 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SHOC2Q9UQ13 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SHOC2Q9UQ13 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SHOC2Q9UQ13 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SHOC2Q9UQ13 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
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