Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
TRAPPC9Q96Q05 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 170.8 ms