Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
CCDC47Q96A33 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CCDC47Q96A33 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CCDC47Q96A33 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
CCDC47Q96A33 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CCDC47Q96A33 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
CCDC47Q96A33 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CCDC47Q96A33 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CCDC47Q96A33 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CCDC47Q96A33 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CCDC47Q96A33 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CCDC47Q96A33 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CCDC47Q96A33 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CCDC47Q96A33 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CCDC47Q96A33 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CCDC47Q96A33 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CCDC47Q96A33 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CCDC47Q96A33 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CCDC47Q96A33 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CCDC47Q96A33 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CCDC47Q96A33 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CCDC47Q96A33 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
CCDC47Q96A33 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
CCDC47Q96A33 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CCDC47Q96A33 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CCDC47Q96A33 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CCDC47Q96A33 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CCDC47Q96A33 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CCDC47Q96A33 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CCDC47Q96A33 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CCDC47Q96A33 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CCDC47Q96A33 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.37□□□□□ -2.19
CCDC47Q96A33 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CCDC47Q96A33 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CCDC47Q96A33 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC1.37□□□□□ -2.19
CCDC47Q96A33 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CCDC47Q96A33 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC1.37□□□□□ -2.19
CCDC47Q96A33 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CCDC47Q96A33 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CCDC47Q96A33 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CCDC47Q96A33 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CCDC47Q96A33 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
CCDC47Q96A33 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CCDC47Q96A33 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CCDC47Q96A33 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CCDC47Q96A33 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CCDC47Q96A33 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CCDC47Q96A33 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CCDC47Q96A33 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CCDC47Q96A33 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC1.36□□□□□ -2.19
CCDC47Q96A33 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CCDC47Q96A33 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
CCDC47Q96A33 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CCDC47Q96A33 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CCDC47Q96A33 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC1.36□□□□□ -2.19
CCDC47Q96A33 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
CCDC47Q96A33 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
CCDC47Q96A33 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CCDC47Q96A33 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CCDC47Q96A33 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CCDC47Q96A33 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CCDC47Q96A33 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CCDC47Q96A33 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CCDC47Q96A33 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CCDC47Q96A33 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CCDC47Q96A33 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CCDC47Q96A33 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CCDC47Q96A33 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CCDC47Q96A33 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.35□□□□□ -2.19
CCDC47Q96A33 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CCDC47Q96A33 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CCDC47Q96A33 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CCDC47Q96A33 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CCDC47Q96A33 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CCDC47Q96A33 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CCDC47Q96A33 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CCDC47Q96A33 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
CCDC47Q96A33 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CCDC47Q96A33 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CCDC47Q96A33 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CCDC47Q96A33 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
CCDC47Q96A33 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CCDC47Q96A33 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CCDC47Q96A33 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CCDC47Q96A33 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CCDC47Q96A33 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CCDC47Q96A33 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
CCDC47Q96A33 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CCDC47Q96A33 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CCDC47Q96A33 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CCDC47Q96A33 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
CCDC47Q96A33 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CCDC47Q96A33 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CCDC47Q96A33 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CCDC47Q96A33 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CCDC47Q96A33 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CCDC47Q96A33 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CCDC47Q96A33 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
CCDC47Q96A33 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CCDC47Q96A33 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
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