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| PTPRN | Q16849 | MIR3944-201 | ENST00000581277 | 108 nt | BASIC | 4.14 | □□□□□ -1.75 | | |
| PTPRN | Q16849 | MIR6868-201 | ENST00000611215 | 58 nt | BASIC | 4.14 | □□□□□ -1.75 | | |
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| PTPRN | Q16849 | AL033397.1-201 | ENST00000502390 | 3653 nt | TSL 2 BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
| PTPRN | Q16849 | Z82217.1-201 | ENST00000625157 | 8149 nt | BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
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| PTPRN | Q16849 | AL161912.2-201 | ENST00000565707 | 3007 nt | BASIC | 4.11 | □□□□□ -1.75 | | |
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| PTPRN | Q16849 | Y_RNA.549-201 | ENST00000384657 | 102 nt | BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
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| PTPRN | Q16849 | AC092941.1-201 | ENST00000415940 | 427 nt | TSL 5 BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| PTPRN | Q16849 | GOT2P5-201 | ENST00000433995 | 546 nt | BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| PTPRN | Q16849 | RPL23AP83-201 | ENST00000434984 | 473 nt | BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| PTPRN | Q16849 | PRSS3P4-201 | ENST00000453323 | 162 nt | BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| PTPRN | Q16849 | RN7SL807P-201 | ENST00000470923 | 297 nt | BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| PTPRN | Q16849 | AC025627.2-201 | ENST00000576220 | 160 nt | BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| PTPRN | Q16849 | ZNF107-203 | ENST00000395391 | 6094 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| PTPRN | Q16849 | SLC38A2-209 | ENST00000551374 | 2802 nt | TSL 2 BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| PTPRN | Q16849 | ZC3H11A-214 | ENST00000639812 | 11825 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| PTPRN | Q16849 | AC087190.4-201 | ENST00000574616 | 8334 nt | BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| PTPRN | Q16849 | TUG1-201 | ENST00000519077 | 5673 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.1 | □□□□□ -1.75 | | |
| PTPRN | Q16849 | AL049781.1-201 | ENST00000623195 | 3585 nt | BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |
| PTPRN | Q16849 | ZNF962P-201 | ENST00000443465 | 3140 nt | BASIC | 4.09 | □□□□□ -1.75 | | |