Protein–RNA interactions for Protein: Q16560

SNRNP35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP35Q16560 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.17□□□□□ -2.22
SNRNP35Q16560 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SNRNP35Q16560 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
SNRNP35Q16560 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SNRNP35Q16560 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SNRNP35Q16560 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
SNRNP35Q16560 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SNRNP35Q16560 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SNRNP35Q16560 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SNRNP35Q16560 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SNRNP35Q16560 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SNRNP35Q16560 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SNRNP35Q16560 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SNRNP35Q16560 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SNRNP35Q16560 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
SNRNP35Q16560 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SNRNP35Q16560 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SNRNP35Q16560 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SNRNP35Q16560 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SNRNP35Q16560 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SNRNP35Q16560 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
SNRNP35Q16560 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SNRNP35Q16560 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SNRNP35Q16560 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SNRNP35Q16560 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SNRNP35Q16560 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SNRNP35Q16560 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SNRNP35Q16560 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SNRNP35Q16560 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
SNRNP35Q16560 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SNRNP35Q16560 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SNRNP35Q16560 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SNRNP35Q16560 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SNRNP35Q16560 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SNRNP35Q16560 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SNRNP35Q16560 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SNRNP35Q16560 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SNRNP35Q16560 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
SNRNP35Q16560 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SNRNP35Q16560 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
SNRNP35Q16560 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC1.15□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC1.15□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.14□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SNRNP35Q16560 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
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