Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
SNAPC1Q16533 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
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