Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.77□□□□□ -2.29
TNXAQ16473 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TNXAQ16473 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TNXAQ16473 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TNXAQ16473 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TNXAQ16473 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TNXAQ16473 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.77□□□□□ -2.29
TNXAQ16473 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TNXAQ16473 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TNXAQ16473 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
TNXAQ16473 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TNXAQ16473 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TNXAQ16473 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TNXAQ16473 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TNXAQ16473 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TNXAQ16473 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
TNXAQ16473 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
TNXAQ16473 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TNXAQ16473 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TNXAQ16473 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TNXAQ16473 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TNXAQ16473 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TNXAQ16473 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC0.76□□□□□ -2.29
TNXAQ16473 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TNXAQ16473 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TNXAQ16473 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TNXAQ16473 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
TNXAQ16473 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TNXAQ16473 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TNXAQ16473 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
TNXAQ16473 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TNXAQ16473 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TNXAQ16473 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TNXAQ16473 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TNXAQ16473 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TNXAQ16473 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TNXAQ16473 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TNXAQ16473 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TNXAQ16473 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TNXAQ16473 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TNXAQ16473 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TNXAQ16473 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TNXAQ16473 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC0.76□□□□□ -2.29
TNXAQ16473 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC0.76□□□□□ -2.29
TNXAQ16473 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC0.76□□□□□ -2.29
TNXAQ16473 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.75□□□□□ -2.29
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TNXAQ16473 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TNXAQ16473 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC0.73□□□□□ -2.29
TNXAQ16473 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TNXAQ16473 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TNXAQ16473 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TNXAQ16473 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TNXAQ16473 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TNXAQ16473 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC0.73□□□□□ -2.29
TNXAQ16473 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC0.73□□□□□ -2.29
TNXAQ16473 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC0.73□□□□□ -2.29
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TNXAQ16473 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
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TNXAQ16473 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TNXAQ16473 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TNXAQ16473 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TNXAQ16473 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
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