Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CCDC6Q16204 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CCDC6Q16204 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CCDC6Q16204 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CCDC6Q16204 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CCDC6Q16204 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CCDC6Q16204 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CCDC6Q16204 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CCDC6Q16204 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CCDC6Q16204 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CCDC6Q16204 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CCDC6Q16204 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CCDC6Q16204 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CCDC6Q16204 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CCDC6Q16204 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CCDC6Q16204 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CCDC6Q16204 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CCDC6Q16204 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CCDC6Q16204 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CCDC6Q16204 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CCDC6Q16204 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CCDC6Q16204 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CCDC6Q16204 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CCDC6Q16204 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CCDC6Q16204 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CCDC6Q16204 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CCDC6Q16204 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CCDC6Q16204 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CCDC6Q16204 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
CCDC6Q16204 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CCDC6Q16204 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CCDC6Q16204 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CCDC6Q16204 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
CCDC6Q16204 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CCDC6Q16204 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CCDC6Q16204 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CCDC6Q16204 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CCDC6Q16204 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CCDC6Q16204 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CCDC6Q16204 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CCDC6Q16204 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CCDC6Q16204 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CCDC6Q16204 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CCDC6Q16204 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CCDC6Q16204 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CCDC6Q16204 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CCDC6Q16204 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CCDC6Q16204 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CCDC6Q16204 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CCDC6Q16204 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CCDC6Q16204 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CCDC6Q16204 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CCDC6Q16204 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CCDC6Q16204 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CCDC6Q16204 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CCDC6Q16204 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CCDC6Q16204 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CCDC6Q16204 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
CCDC6Q16204 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CCDC6Q16204 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CCDC6Q16204 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CCDC6Q16204 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
CCDC6Q16204 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CCDC6Q16204 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CCDC6Q16204 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CCDC6Q16204 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CCDC6Q16204 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CCDC6Q16204 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CCDC6Q16204 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CCDC6Q16204 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CCDC6Q16204 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CCDC6Q16204 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CCDC6Q16204 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CCDC6Q16204 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
CCDC6Q16204 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CCDC6Q16204 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CCDC6Q16204 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CCDC6Q16204 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CCDC6Q16204 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CCDC6Q16204 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CCDC6Q16204 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CCDC6Q16204 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CCDC6Q16204 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CCDC6Q16204 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CCDC6Q16204 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CCDC6Q16204 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CCDC6Q16204 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CCDC6Q16204 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CCDC6Q16204 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CCDC6Q16204 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CCDC6Q16204 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
CCDC6Q16204 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CCDC6Q16204 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CCDC6Q16204 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CCDC6Q16204 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CCDC6Q16204 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CCDC6Q16204 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CCDC6Q16204 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CCDC6Q16204 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CCDC6Q16204 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
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