Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SNCBQ16143 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SNCBQ16143 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SNCBQ16143 MTND1P22-201ENST00000510572 951 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SNCBQ16143 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SNCBQ16143 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
SNCBQ16143 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
SNCBQ16143 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SNCBQ16143 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SNCBQ16143 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SNCBQ16143 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SNCBQ16143 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
SNCBQ16143 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SNCBQ16143 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
SNCBQ16143 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SNCBQ16143 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SNCBQ16143 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SNCBQ16143 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SNCBQ16143 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SNCBQ16143 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SNCBQ16143 AC004854.1-201ENST00000440356 349 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SNCBQ16143 EXOSC3P1-201ENST00000448649 500 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SNCBQ16143 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
SNCBQ16143 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SNCBQ16143 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
SNCBQ16143 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
SNCBQ16143 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
SNCBQ16143 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
SNCBQ16143 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SNCBQ16143 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
SNCBQ16143 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SNCBQ16143 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SNCBQ16143 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SNCBQ16143 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SNCBQ16143 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SNCBQ16143 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SNCBQ16143 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SNCBQ16143 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SNCBQ16143 AC106883.1-201ENST00000418805 562 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SNCBQ16143 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SNCBQ16143 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SNCBQ16143 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SNCBQ16143 RNU6-276P-201ENST00000516114 96 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SNCBQ16143 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SNCBQ16143 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
SNCBQ16143 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
SNCBQ16143 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
SNCBQ16143 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SNCBQ16143 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SNCBQ16143 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SNCBQ16143 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SNCBQ16143 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SNCBQ16143 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SNCBQ16143 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SNCBQ16143 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SNCBQ16143 MTCO2P6-201ENST00000463134 685 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SNCBQ16143 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SNCBQ16143 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
SNCBQ16143 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
SNCBQ16143 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SNCBQ16143 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SNCBQ16143 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SNCBQ16143 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SNCBQ16143 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SNCBQ16143 BNIP3P40-201ENST00000596017 556 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SNCBQ16143 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SNCBQ16143 Y_RNA.110-201ENST00000363220 99 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SNCBQ16143 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SNCBQ16143 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SNCBQ16143 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SNCBQ16143 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.05□□□□□ -2.42
SNCBQ16143 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SNCBQ16143 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SNCBQ16143 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SNCBQ16143 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SNCBQ16143 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
SNCBQ16143 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SNCBQ16143 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SNCBQ16143 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SNCBQ16143 LINC01218-201ENST00000515150 481 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
SNCBQ16143 SNORA19.3-201ENST00000516165 130 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SNCBQ16143 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SNCBQ16143 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SNCBQ16143 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SNCBQ16143 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SNCBQ16143 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SNCBQ16143 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SNCBQ16143 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SNCBQ16143 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SNCBQ16143 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SNCBQ16143 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SNCBQ16143 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SNCBQ16143 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SNCBQ16143 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SNCBQ16143 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SNCBQ16143 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
SNCBQ16143 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SNCBQ16143 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SNCBQ16143 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
SNCBQ16143 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 191.1 ms