Protein–RNA interactions for Protein: Q15436

SEC23A, Protein transport protein Sec23A, humanhuman

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Length 765 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23AQ15436 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
SEC23AQ15436 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SEC23AQ15436 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
SEC23AQ15436 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SEC23AQ15436 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SEC23AQ15436 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SEC23AQ15436 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SEC23AQ15436 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SEC23AQ15436 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SEC23AQ15436 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
SEC23AQ15436 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SEC23AQ15436 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SEC23AQ15436 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SEC23AQ15436 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SEC23AQ15436 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SEC23AQ15436 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SEC23AQ15436 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SEC23AQ15436 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SEC23AQ15436 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SEC23AQ15436 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SEC23AQ15436 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SEC23AQ15436 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SEC23AQ15436 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
SEC23AQ15436 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SEC23AQ15436 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
SEC23AQ15436 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
SEC23AQ15436 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
SEC23AQ15436 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
SEC23AQ15436 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SEC23AQ15436 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SEC23AQ15436 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SEC23AQ15436 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
SEC23AQ15436 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SEC23AQ15436 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
SEC23AQ15436 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SEC23AQ15436 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
SEC23AQ15436 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SEC23AQ15436 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SEC23AQ15436 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
SEC23AQ15436 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
SEC23AQ15436 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
SEC23AQ15436 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC3.15□□□□□ -1.9
SEC23AQ15436 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC3.14□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SEC23AQ15436 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
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