Protein–RNA interactions for Protein: Q15036

SNX17, Sorting nexin-17, humanhuman

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX17Q15036 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
SNX17Q15036 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SNX17Q15036 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SNX17Q15036 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SNX17Q15036 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SNX17Q15036 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SNX17Q15036 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SNX17Q15036 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SNX17Q15036 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SNX17Q15036 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SNX17Q15036 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SNX17Q15036 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SNX17Q15036 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SNX17Q15036 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SNX17Q15036 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SNX17Q15036 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SNX17Q15036 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SNX17Q15036 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SNX17Q15036 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SNX17Q15036 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SNX17Q15036 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SNX17Q15036 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SNX17Q15036 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SNX17Q15036 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SNX17Q15036 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SNX17Q15036 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SNX17Q15036 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SNX17Q15036 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SNX17Q15036 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SNX17Q15036 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SNX17Q15036 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SNX17Q15036 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SNX17Q15036 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SNX17Q15036 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SNX17Q15036 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SNX17Q15036 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SNX17Q15036 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SNX17Q15036 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SNX17Q15036 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SNX17Q15036 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SNX17Q15036 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SNX17Q15036 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SNX17Q15036 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SNX17Q15036 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SNX17Q15036 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SNX17Q15036 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SNX17Q15036 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SNX17Q15036 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SNX17Q15036 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SNX17Q15036 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SNX17Q15036 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SNX17Q15036 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SNX17Q15036 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SNX17Q15036 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SNX17Q15036 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SNX17Q15036 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SNX17Q15036 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SNX17Q15036 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SNX17Q15036 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SNX17Q15036 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SNX17Q15036 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SNX17Q15036 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SNX17Q15036 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SNX17Q15036 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SNX17Q15036 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SNX17Q15036 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SNX17Q15036 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SNX17Q15036 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SNX17Q15036 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SNX17Q15036 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SNX17Q15036 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SNX17Q15036 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
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SNX17Q15036 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
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SNX17Q15036 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SNX17Q15036 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SNX17Q15036 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SNX17Q15036 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SNX17Q15036 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SNX17Q15036 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SNX17Q15036 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SNX17Q15036 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SNX17Q15036 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SNX17Q15036 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SNX17Q15036 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SNX17Q15036 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SNX17Q15036 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SNX17Q15036 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
SNX17Q15036 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
SNX17Q15036 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SNX17Q15036 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
SNX17Q15036 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
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