Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC1.95□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC1.94□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
HERC3Q15034 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
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