Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 HSFY5P-201ENST00000453726 309 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC-0.65□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 MTND2P6-201ENST00000455337 1030 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 AC026616.1-201ENST00000523157 525 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 AL354696.1-201ENST00000614652 497 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SHPRHQ149N8 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SHPRHQ149N8 MIR196A2-201ENST00000385189 110 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SHPRHQ149N8 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SHPRHQ149N8 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC-0.66□□□□□ -2.52
SHPRHQ149N8 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SHPRHQ149N8 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SHPRHQ149N8 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SHPRHQ149N8 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SHPRHQ149N8 EIF1AXP2-201ENST00000555940 413 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SHPRHQ149N8 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC-0.66□□□□□ -2.52
SHPRHQ149N8 DLG2-AS1_1.1-201ENST00000622319 213 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SHPRHQ149N8 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.67□□□□□ -2.52
SHPRHQ149N8 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SHPRHQ149N8 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SHPRHQ149N8 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SHPRHQ149N8 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SHPRHQ149N8 MTCO2P8-201ENST00000412213 658 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SHPRHQ149N8 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC-0.67□□□□□ -2.52
SHPRHQ149N8 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SHPRHQ149N8 AC007000.2-201ENST00000442564 487 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SHPRHQ149N8 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SHPRHQ149N8 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC-0.67□□□□□ -2.52
SHPRHQ149N8 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SHPRHQ149N8 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SHPRHQ149N8 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SHPRHQ149N8 PPP2R2A-224ENST00000640787 318 ntTSL 5 BASIC-0.67□□□□□ -2.52
SHPRHQ149N8 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SHPRHQ149N8 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SHPRHQ149N8 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SHPRHQ149N8 RNU7-165P-201ENST00000458864 60 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SHPRHQ149N8 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC-0.68□□□□□ -2.52
SHPRHQ149N8 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC-0.68□□□□□ -2.52
SHPRHQ149N8 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SHPRHQ149N8 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SHPRHQ149N8 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SHPRHQ149N8 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SHPRHQ149N8 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SHPRHQ149N8 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SHPRHQ149N8 AC106883.1-201ENST00000418805 562 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SHPRHQ149N8 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SHPRHQ149N8 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
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SHPRHQ149N8 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
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SHPRHQ149N8 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SHPRHQ149N8 AC083799.1-201ENST00000366451 910 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SHPRHQ149N8 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SHPRHQ149N8 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SHPRHQ149N8 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SHPRHQ149N8 AC124016.2-201ENST00000610058 665 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
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SHPRHQ149N8 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
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SHPRHQ149N8 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SHPRHQ149N8 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SHPRHQ149N8 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC-0.7□□□□□ -2.52
SHPRHQ149N8 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SHPRHQ149N8 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SHPRHQ149N8 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SHPRHQ149N8 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SHPRHQ149N8 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SHPRHQ149N8 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC-0.7□□□□□ -2.52
SHPRHQ149N8 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SHPRHQ149N8 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SHPRHQ149N8 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SHPRHQ149N8 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SHPRHQ149N8 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SHPRHQ149N8 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SHPRHQ149N8 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SHPRHQ149N8 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SHPRHQ149N8 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SHPRHQ149N8 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SHPRHQ149N8 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SHPRHQ149N8 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC-0.71□□□□□ -2.52
SHPRHQ149N8 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC-0.71□□□□□ -2.52
SHPRHQ149N8 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SHPRHQ149N8 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC-0.71□□□□□ -2.52
SHPRHQ149N8 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SHPRHQ149N8 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SHPRHQ149N8 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SHPRHQ149N8 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC-0.72□□□□□ -2.52
SHPRHQ149N8 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SHPRHQ149N8 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SHPRHQ149N8 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SHPRHQ149N8 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SHPRHQ149N8 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SHPRHQ149N8 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC-0.72□□□□□ -2.52
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